14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0557 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 246 aa  481  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  67.22 
 
 		 230 aa  299  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  66.94 
 
 		 224 aa  295  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  63.12 
 
 		 237 aa  291  8e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  60.7 
 
 		 218 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  30.67 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  31.91 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  30.05 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  30.04 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  30.04 
 
 		 180 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  28.77 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  24.41 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  27.52 
 
 		 172 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  25.54 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>