12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1527 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1527  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  970    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0153  hypothetical protein  46.84 
 
 
462 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0633  hypothetical protein  40.19 
 
 
482 aa  272  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2226  hypothetical protein  25.73 
 
 
602 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2011  hypothetical protein  26.99 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2392  hypothetical protein  21.98 
 
 
453 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.514356  normal  0.55434 
 
 
-
 
NC_002950  PG1178  hypothetical protein  25.54 
 
 
425 aa  53.9  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2785  hypothetical protein  24.85 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.191276  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2970  hypothetical protein  24.85 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08470  hypothetical protein  21.04 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0368  hypothetical protein  23.53 
 
 
570 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3284  hypothetical protein  27.89 
 
 
475 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>