20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0818 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0818  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  334  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676799  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0738  hypothetical protein  40.14 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1390  cation antiporter  35.53 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2735  cation antiporter  32.88 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1006  cation antiporter  40.66 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1287  cation antiporter  33.33 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.412588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1613  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.53 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2669  cation antiporter  36.89 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01530  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  38.38 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0897  cation antiporter  26.95 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.675362  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1210  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.07 
 
 		 160 aa  51.2  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  32.8 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  31.18 
 
 		 344 aa  48.9  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.951663 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0386  cation antiporter  26 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.265532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0838  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.34 
 
 		 421 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  34.12 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0501  cation antiporter  22.3 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000454407  hitchhiker  0.0000410106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2168  cation antiporter  27.93 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3453  cation antiporter  28.47 
 
 		 349 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2216  membrane bound protein complex subunit mbxA  27.45 
 
 		 172 aa  42  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0700259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>