20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0744 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0744  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  200  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1818  hypothetical protein  46.6 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000143268  hitchhiker  0.0000000000225377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1467  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3271  hypothetical protein  44.66 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0817  DNA polymerase beta subunit  41.18 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0151  hypothetical protein  46.08 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000205386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0863  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1984  DNA polymerase beta subunit  46.08 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1806  DNA polymerase beta domain protein region  46.6 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.897412  hitchhiker  0.0000000124073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0008  DNA polymerase beta domain protein region  36.27 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0646  DNA polymerase beta subunit  41.35 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0233  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2721  DNA polymerase, beta-like region  33.02 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000295369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1147  DNA polymerase beta domain protein region  31 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0753  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1383  hypothetical protein  36.19 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0242  DNA polymerase beta domain protein region  33.98 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2462  DNA polymerase, beta-like region  38.55 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0521  DNA polymerase beta domain protein region  44.68 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3387  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>