20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1850 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  100 
 
 
159 aa  312  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  39.1 
 
 
563 aa  103  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3262  PRC-barrel domain-containing protein  34.59 
 
 
230 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  30.19 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  27.95 
 
 
347 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  28.66 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  25.95 
 
 
301 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  25.81 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  25.83 
 
 
248 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  23.42 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  27.07 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  26.75 
 
 
152 aa  51.6  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  28.85 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  22.29 
 
 
268 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0886  hypothetical protein  26.42 
 
 
259 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0532  hypothetical protein  26.43 
 
 
286 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3061  hypothetical protein  29.41 
 
 
268 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.488038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  28.36 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1421  PRC-barrel domain-containing protein  29.27 
 
 
346 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01221  hypothetical protein  29.27 
 
 
346 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>