More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0375 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0375  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 336 aa  664    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  63.93 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  59.58 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  56.8 
 
 		 347 aa  381  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  58.63 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  57.96 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  55.92 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  56.51 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  56.59 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.25 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  56.51 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  55.85 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  55.85 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  55.46 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  55.82 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.64 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 339 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  53.73 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  55.33 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  55.46 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  58.72 
 
 		 343 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  55.21 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.26 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  56.75 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 343 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 347 aa  362  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  54.65 
 
 		 336 aa  362  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 359 aa  361  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  55.62 
 
 		 347 aa  360  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  55.22 
 
 		 339 aa  360  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  53.29 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 347 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  54.08 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  54.44 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  54.14 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  53.69 
 
 		 348 aa  359  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  54.05 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 347 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  56.02 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  54.3 
 
 		 343 aa  357  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.03 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  51.65 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  53.17 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  55.66 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  57.66 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 347 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  54.13 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  52.38 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  52.55 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>