21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0372 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  296  8e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0618  hypothetical protein  67.2 
 
 		 132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.787668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1687  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.496832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1353  hypothetical protein  44.86 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17670  hypothetical protein  42.45 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00814733  normal  0.12232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1332  hypothetical protein  35 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0774842  normal  0.287418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1816  hypothetical protein  40.74 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1692  hypothetical protein  31.29 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00793955  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3216  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629632  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2280  secreted protein  36.28 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5267  hypothetical protein  34.11 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.283162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15250  hypothetical protein  37.38 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0118972  normal  0.286282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2017  secreted protein  33.93 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000921517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2012  hypothetical protein  39.64 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507518  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3160  secreted protein  35.19 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6096  hypothetical protein  26.61 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0752987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2073  putative secreted protein  26.67 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2376  hypothetical protein  27.86 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3086  putative secreted protein  29.37 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2049  hypothetical protein  24.59 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3880  hypothetical protein  30.86 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.628101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>