20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2945 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2408  OmpW family protein  49.03 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00013458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0073  outer membrane protein, putative  43.63 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3960  hypothetical protein  48.82 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000187243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0561  hypothetical protein  43.89 
 
 		 196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.01609e-34 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0290  hypothetical protein  42.23 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0549  hypothetical protein  42.78 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000486601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0309  hypothetical protein  44.66 
 
 		 199 aa  157  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000916474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1159  OmpW family protein  38.67 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3522  outer membrane protein, putative  47.34 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.550518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1840  OmpW family protein  35.55 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0984  hypothetical protein  29.46 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.873702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1086  hypothetical protein  29.46 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1053  hypothetical protein  30.17 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3305  hypothetical protein  29.46 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0523546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  26.55 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  26.21 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0996  hypothetical protein  29.31 
 
 		 212 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.708281  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0812  hypothetical protein  26.76 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.25 
 
 		 427 aa  41.6  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>