15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0812 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0812  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0811  hypothetical protein  62.56 
 
 		 192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0233  hypothetical protein  30.06 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7021  hypothetical protein  28.18 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1453  hypothetical protein  34.26 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1613  hypothetical protein  25.97 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  28.57 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1517  hypothetical protein  24.81 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0126  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3442  hypothetical protein  27.04 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  30.63 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  30.63 
 
 		 201 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  29.33 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  27.74 
 
 		 199 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1518  hypothetical protein  27.07 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>