33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2439 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  44.13 
 
 
261 aa  214  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  44.67 
 
 
261 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  45.53 
 
 
241 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  29.63 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  33.63 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  29.2 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  35.6 
 
 
245 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  29.63 
 
 
267 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  32.61 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  30.43 
 
 
257 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  32.17 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  31.74 
 
 
260 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6147  hypothetical protein  27.04 
 
 
253 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  28.82 
 
 
330 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6496  hypothetical protein  26.85 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  28.02 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6005  hypothetical protein  26.85 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5640  hypothetical protein  26.85 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7414  hypothetical protein  26.61 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  27.6 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  26.79 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  27.78 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  24.78 
 
 
241 aa  58.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19650  hypothetical protein  23.33 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  27.03 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.34 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  26.09 
 
 
267 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>