19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0936 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0936  hypothetical protein  100 
 
 
801 aa  1519    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0831  hypothetical protein  32.74 
 
 
690 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.608247  normal  0.0708988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2639  hypothetical protein  33.75 
 
 
699 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.28 
 
 
643 aa  87.8  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 
561 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  35.82 
 
 
331 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  41.18 
 
 
333 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  41.18 
 
 
333 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  40.68 
 
 
332 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  41.18 
 
 
318 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  40.83 
 
 
334 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  41.53 
 
 
330 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  47.67 
 
 
966 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.86 
 
 
453 aa  51.6  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  44.32 
 
 
303 aa  48.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  46.94 
 
 
880 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31752  predicted protein  54.84 
 
 
1048 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0703442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  43.75 
 
 
996 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  43.09 
 
 
831 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>