18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0577 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0266  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.485965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  29.66 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  27.97 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  27.93 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  29.13 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  26.27 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  26.05 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  29.47 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  34.52 
 
 		 90 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  27.19 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  23.93 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  22.03 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  25.62 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0408  hypothetical protein  25.23 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.528155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 93 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3220  type IV pilus assembly PilZ  26.61 
 
 		 804 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>