25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4116 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4116  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
299 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2144  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.5 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.891643  hitchhiker  0.000531775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2469  cell wall anchor domain-containing protein  36.36 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2340  cell wall anchor domain-containing protein  37.23 
 
 
259 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2171  hypothetical protein  32.33 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221923  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0598  hypothetical protein  37.74 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2803  hypothetical protein  35.56 
 
 
715 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1378  hypothetical protein  39.38 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0999  cell wall anchor domain-containing protein  32.88 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000353845  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2573  hypothetical protein  27.94 
 
 
217 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2068  hypothetical protein  36.25 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1325  hypothetical protein  43.48 
 
 
351 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213882  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05210  hypothetical protein  27.23 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0725  hypothetical protein  27.78 
 
 
423 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2111  hypothetical protein  24 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2401  hypothetical protein  23.12 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2326  hypothetical protein  23.72 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3105  hypothetical protein  35.09 
 
 
280 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.58027  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1389  hypothetical protein  28.8 
 
 
232 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0507165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2072  hypothetical protein  23.08 
 
 
249 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.562023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2317  hypothetical protein  22.67 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2076  hypothetical protein  22.67 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2138  hypothetical protein  22.67 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2292  hypothetical protein  22.67 
 
 
251 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5822  hypothetical protein  27.13 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  hitchhiker  0.00490429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>