17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2361 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  31.25 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  27.2 
 
 		 389 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  25.95 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0849  hypothetical protein  34.71 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  27.06 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  26.17 
 
 		 366 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  26.18 
 
 		 439 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  26.21 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  31.43 
 
 		 405 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  28.38 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  35.56 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  28.3 
 
 		 583 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  29.25 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  28.35 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  30.77 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  27.18 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>