22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2402 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2402  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000157501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1167  hypothetical protein  84.48 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2893  hypothetical protein  56.14 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000100997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  42.24 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2513  hypothetical protein  50.43 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00274394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1706  hypothetical protein  49.57 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0633e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1722  hypothetical protein  47.32 
 
 		 115 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  36.36 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1343  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.914236  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1315  hypothetical protein  34.58 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  33.93 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  26.53 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  26.53 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  28.32 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  27.83 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0438  hypothetical protein  38.27 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2264  hypothetical protein  29.7 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1964  hypothetical protein  32.2 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2325  hypothetical protein  32.2 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.142274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0479  hypothetical protein  32.65 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1155  hypothetical protein  29 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0011956  hitchhiker  0.0048484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>