37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2288 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2288  class II aldolase/adducin-like  100 
 
 		 391 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00052721  normal  0.0891696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2190  class II aldolase and adducin N-terminal domain-containing protein  82.69 
 
 		 388 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3265  class II aldolase/adducin family protein  74.55 
 
 		 389 aa  591  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0906  class II aldolase/adducin family protein  73.11 
 
 		 385 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58056e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3340  class II aldolase/adducin family protein  73.3 
 
 		 386 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1876  class II aldolase/adducin family protein  41.34 
 
 		 382 aa  276  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000546395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1249  L-fuculose phosphate aldolase  37.04 
 
 		 189 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1355  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 		 191 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0389357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2210  L-fuculose phosphate aldolase  32.97 
 
 		 183 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000461155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1385  L-fuculose phosphate aldolase  34.21 
 
 		 193 aa  93.2  7e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.190215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1641  L-fuculose phosphate aldolase  33.33 
 
 		 193 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.515005  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1523  aldolase, class II  32.8 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.854462  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1450  L-fuculose phosphate aldolase  31.89 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.571414  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1801  L-fuculose phosphate aldolase  29.78 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30516  normal  0.168684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1027  L-fuculose phosphate aldolase  28.26 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0314  L-fuculose phosphate aldolase  30 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1661  L-fuculose phosphate aldolase  30.46 
 
 		 180 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  30.18 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3173  L-fuculose phosphate aldolase  29.38 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  33.15 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1037  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.093036  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1876  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 		 214 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.313117  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  29.53 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  26.06 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  28.11 
 
 		 209 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0426  class II aldolase/adducin family protein  27.68 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000249785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  27.07 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  33.98 
 
 		 222 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  29.21 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  29.13 
 
 		 220 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  30.69 
 
 		 220 aa  46.6  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  26.52 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  28.64 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.2 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  32.69 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  31.06 
 
 		 218 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4810  class II aldolase/adducin family protein  24.59 
 
 		 230 aa  43.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.86803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>