More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0023 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0023  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0007  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0052  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0013  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0119522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0044  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.541664  hitchhiker  0.000000158432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0032  tRNA-Ala  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0119257  normal  0.670174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0049  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000677236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0015  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0358184  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0013  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0051  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0056  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0050  tRNA-Ala  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.903687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0055  tRNA-Ala  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.186103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  97.67 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0133528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0057  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0008  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00058082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0018  tRNA-Ala  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00140514  normal  0.720887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t49  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t69  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.595714  hitchhiker  0.00914053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5641  tRNA-Ile  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5644  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0050  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0340  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0346  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0557  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0563  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3906  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t063  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t095  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t04  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t10  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t16  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.266667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.511469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000114514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ala-6  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000288872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-1  tRNA-Ala  100 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000494003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00200718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-4  tRNA-Ala  100 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ala-5  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000442244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA15  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.140136  normal  0.0102335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA50  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000979507  normal  0.305106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA6  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0168581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA72  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA81  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00142149  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R14  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000817824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R3  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00599738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R43  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000550301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R58  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R79  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916269  hitchhiker  0.00756682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R92  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000124955  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0032  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0134  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000329737  normal  0.0145655 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0283153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0046  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0144833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0117  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00397106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00133969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0632533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0017  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0175356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0024  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0082  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000141223  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla01  tRNA-Ala  100 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tAla02  tRNA-Ala  100 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.306257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0073  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0694926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0009  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.441626  hitchhiker  0.00992497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000187329  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0073  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0105913  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00464814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0063  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00661902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>