17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1516 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00121071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  47.62 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.86 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  44.55 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2680  hypothetical protein  46.99 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  40.96 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  36.54 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4466  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0881453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  47.13 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19020  VanZ-like protein  38.89 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3829  VanZ family protein  32.67 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.942243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6628  VanZ family protein  37.23 
 
 		 108 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  36 
 
 		 127 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  37.84 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  31.96 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1099  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2830  hypothetical protein  39.08 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>