14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2796 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2796  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  401  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232161  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  84.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  35.46 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3681  hypothetical protein  32.58 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  30.81 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  36.61 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  29.34 
 
 
169 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  27.23 
 
 
185 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  26.37 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  28.19 
 
 
192 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  27.59 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  31.39 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2626  hypothetical protein  34.48 
 
 
114 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  26.13 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>