18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2595 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3355    96.62 
 
 		 2247 bp  2030    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.013502  normal  0.394896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2734    96.6 
 
 		 1974 bp  2018    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0716494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2595    100 
 
 		 3459 bp  6857    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  82.98 
 
 		 2181 bp  89.7  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  87.95 
 
 		 2214 bp  85.7  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  83.72 
 
 		 2319 bp  60  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  83.72 
 
 		 2319 bp  60  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  100 
 
 		 4326 bp  58  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  89.58 
 
 		 684 bp  56  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0056  hypothetical protein  96.77 
 
 		 8040 bp  54  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.602314 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  96.77 
 
 		 2013 bp  54  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  96.77 
 
 		 4008 bp  54  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  96.77 
 
 		 1608 bp  54  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3197  hypothetical protein  100 
 
 		 702 bp  52  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  96.67 
 
 		 2874 bp  52  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0946  hypothetical protein  96.55 
 
 		 1230 bp  50.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.277217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  96.55 
 
 		 2688 bp  50.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  87.76 
 
 		 2232 bp  50.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>