28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0240 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  100 
 
 		 600 aa  1205    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  39.15 
 
 		 671 aa  372  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  39.89 
 
 		 660 aa  343  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  38.67 
 
 		 665 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  39.83 
 
 		 680 aa  337  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  37.44 
 
 		 720 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  39.39 
 
 		 663 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  37.11 
 
 		 699 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  37.69 
 
 		 679 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  33.74 
 
 		 633 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  38.21 
 
 		 688 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  33.74 
 
 		 633 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  38.21 
 
 		 688 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  38.21 
 
 		 688 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  51.74 
 
 		 773 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  28.19 
 
 		 708 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  26.64 
 
 		 683 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  27.01 
 
 		 683 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  26.84 
 
 		 683 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  26.84 
 
 		 683 aa  147  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  26.84 
 
 		 683 aa  147  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.84 
 
 		 683 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  26.84 
 
 		 683 aa  146  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  40.12 
 
 		 683 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  24.51 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  26.05 
 
 		 361 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  28.29 
 
 		 713 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  27.39 
 
 		 363 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>