24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4462 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0216  putative transmembrane protein  49.64 
 
 		 1384 aa  1095    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4462  hypothetical protein  100 
 
 		 1435 aa  2788    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.8881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10238  transmembrane protein  49.81 
 
 		 1400 aa  1041    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0418  putative transmembrane protein  47.91 
 
 		 1347 aa  970    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280672  normal  0.0494361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0253  putative transmembrane protein  47.69 
 
 		 1408 aa  1019    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640181  normal  0.103172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0236  putative transmembrane protein  49.57 
 
 		 1384 aa  1104    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.635467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0418  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.79 
 
 		 1404 aa  1148    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0226  putative transmembrane protein  49.57 
 
 		 1384 aa  1104    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0207  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.07 
 
 		 1435 aa  568  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.608322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2998  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1342 aa  539  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0440986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0189  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1435 aa  516  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335759  normal  0.93166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3992  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.31 
 
 		 1430 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.589643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.75 
 
 		 1506 aa  473  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0805  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.1 
 
 		 1371 aa  446  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2467  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1403 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1471  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1345 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.984073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5301  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1312 aa  351  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.437695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1165  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1322 aa  322  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5501  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1672 aa  159  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627379  normal  0.180231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1050  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1608 aa  147  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7608  glycosyl transferase family 2  36.26 
 
 		 1299 aa  48.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1193  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 		 1141 aa  47  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1207  glycosyl transferase domain-containing protein  36.71 
 
 		 1121 aa  46.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1264  glycosyl transferase, family 2  33.33 
 
 		 1112 aa  46.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000048928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>