84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1809 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1809  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  100 
 
 		 271 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  62.78 
 
 		 260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.955887  hitchhiker  0.00580332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2788  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  52.75 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000742326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5280  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  50.36 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970105  normal  0.551146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2074  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  52.09 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.334644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4658  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.82 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2049  hypothetical protein  43.64 
 
 		 275 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.86 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1288  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.36 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2048  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  47.06 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1729  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.59 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4792  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.33 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239471  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1085  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.56 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.196121  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3201  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  43.06 
 
 		 310 aa  184  9e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2694  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.58 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3421  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.42 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2968  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  41.76 
 
 		 1139 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2636  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  39.68 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.72 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.79 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  29.92 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  28.16 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.16 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  25.83 
 
 		 499 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  28.5 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.98 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.57 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2108  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.08 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.37 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4506  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  27.35 
 
 		 329 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.73 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.2 
 
 		 490 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.81 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.26 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  33.91 
 
 		 485 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  29.01 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.24 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1224  putative oxidoreductase, molybopterin binding subunit  28.3 
 
 		 336 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.18 
 
 		 450 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.15 
 
 		 292 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.29 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.33 
 
 		 468 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1845  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.38 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000266439  normal  0.132437 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.57 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27160  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM-like protein  29.52 
 
 		 330 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.74 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.73 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.87 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.99 
 
 		 283 aa  45.4  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  26.42 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  26.42 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.42 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.42 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  25.47 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.42 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  22.17 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.67 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.33 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5133  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.84 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.656297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.42 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3319  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.75 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1956  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.93 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0844554 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.82 
 
 		 485 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00247  hypothetical protein  25.75 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.82 
 
 		 485 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.75 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.993722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00244  predicted oxidoreductase with FAD-binding domain  25.75 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  22.73 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1747  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  33.6 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.29 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0296  FAD binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2735  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.05 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.220722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  36.36 
 
 		 335 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677578 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.32 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6669  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  29.66 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.58 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4115  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.48 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  25.94 
 
 		 292 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0331  FAD binding domain in molybdopterin dehydrogenase  25.32 
 
 		 318 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1992  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.42 
 
 		 316 aa  42.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0607  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.39 
 
 		 295 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  24.47 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3208  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.79 
 
 		 291 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.426898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25 
 
 		 305 aa  42  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>