20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1762 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1244    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1763  hypothetical protein  35.39 
 
 
278 aa  128  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13836  hypothetical protein  34.24 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.353538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5642  cutinase  34.57 
 
 
338 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1167  cutinase  33.17 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32950  PE-PPE domain-containing protein  29.29 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0212  hypothetical protein  32.98 
 
 
337 aa  73.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5012  cutinase  32.98 
 
 
335 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5100  cutinase  32.98 
 
 
335 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.802756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5393  cutinase  32.98 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  27.86 
 
 
296 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0475  PE-PPE domain-containing protein  27.23 
 
 
251 aa  54.3  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  hitchhiker  0.00338535 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5535  hypothetical protein  28.81 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.439091 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5937  hypothetical protein  28.81 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252857  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4540  hypothetical protein  26.77 
 
 
480 aa  48.5  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0171  cutinase precursor  28.24 
 
 
313 aa  48.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4030  PE-PPE domain protein  26.21 
 
 
540 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0170  hypothetical protein  26.4 
 
 
334 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1238  hypothetical protein  22.75 
 
 
518 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.207514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0970  hypothetical protein  24 
 
 
527 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>