19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32950  PE-PPE domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  29.8 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0475  PE-PPE domain-containing protein  30.61 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  hitchhiker  0.00338535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1763  hypothetical protein  33.75 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0170  hypothetical protein  32.85 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  29.86 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5642  cutinase  27.16 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5012  cutinase  29.76 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0171  cutinase precursor  28 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5100  cutinase  29.76 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.802756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5393  cutinase  29.76 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.147295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3720  hypothetical protein  29.45 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.079292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1167  cutinase  30 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13836  hypothetical protein  32.09 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.353538 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4540  hypothetical protein  30.67 
 
 		 480 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1939  cutinase  27.48 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1893  cutinase  27.48 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0212  hypothetical protein  32.33 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1873  cutinase  27.03 
 
 		 241 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0829992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>