16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0475 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0475  PE-PPE domain-containing protein  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  hitchhiker  0.00338535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32950  PE-PPE domain-containing protein  30.61 
 
 
316 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1403  hypothetical protein  32.42 
 
 
323 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.663711  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4874  hypothetical protein  33.68 
 
 
626 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1762  hypothetical protein  28.74 
 
 
623 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1763  hypothetical protein  28.8 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11831  PPE family protein  27.08 
 
 
655 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2044  hypothetical protein  29.89 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0124  cutinase  28.4 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2212  hypothetical protein  29.44 
 
 
468 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0167812  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5535  hypothetical protein  32.98 
 
 
457 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.439091 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5937  hypothetical protein  32.98 
 
 
457 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.252857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2825  PE-PPE-like protein  31.86 
 
 
542 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0670236  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2869  hypothetical protein  31.86 
 
 
542 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2852  hypothetical protein  31.86 
 
 
542 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.493175  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5642  cutinase  30.38 
 
 
338 aa  42  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>