More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0631 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4319  amino acid adenylation domain protein  38.73 
 
 
1393 aa  757    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.202034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12404  peptide synthetase mbtF  38.41 
 
 
1461 aa  843    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.41 
 
 
1460 aa  882    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0631  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1529 aa  3024    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3465  amino acid adenylation  39.35 
 
 
1461 aa  882    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2697  amino acid adenylation domain-containing protein  38.41 
 
 
1459 aa  834    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0193464  normal  0.834924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3528  amino acid adenylation domain-containing protein  39.35 
 
 
1461 aa  882    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.567451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3844  amino acid adenylation domain-containing protein  42.17 
 
 
1493 aa  993    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0760504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  37.68 
 
 
7541 aa  739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  36.21 
 
 
4606 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  40.31 
 
 
1344 aa  629  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  32.29 
 
 
4136 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  30.95 
 
 
1990 aa  594  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  31.37 
 
 
5654 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  35.18 
 
 
2614 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  35.9 
 
 
4449 aa  571  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  36.42 
 
 
2365 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  36.81 
 
 
1315 aa  555  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  33.77 
 
 
7310 aa  549  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  34.91 
 
 
3539 aa  548  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  31.28 
 
 
5230 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  31.68 
 
 
5467 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  34.08 
 
 
3410 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.51 
 
 
3629 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  31.68 
 
 
3710 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  37.65 
 
 
1074 aa  528  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  30.1 
 
 
9175 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  29.15 
 
 
6202 aa  522  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  32.15 
 
 
2561 aa  519  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  32.15 
 
 
5620 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  33.76 
 
 
2605 aa  520  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
6999 aa  511  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  32.76 
 
 
4106 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  28.97 
 
 
4336 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  27.71 
 
 
1556 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  27.71 
 
 
1556 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  30.28 
 
 
2855 aa  502  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  30.27 
 
 
2846 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.11 
 
 
4332 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  26.88 
 
 
4080 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  30.77 
 
 
2877 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  29.75 
 
 
2596 aa  496  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  29.74 
 
 
4747 aa  496  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  31.33 
 
 
3962 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  33.73 
 
 
4037 aa  493  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.98 
 
 
5149 aa  492  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  29.08 
 
 
4336 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  28.95 
 
 
5213 aa  489  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  29.22 
 
 
4502 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.17 
 
 
3470 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.09 
 
 
4960 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  27.26 
 
 
3498 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  36.49 
 
 
4090 aa  485  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.4 
 
 
4960 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  29.44 
 
 
2878 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.9 
 
 
5328 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.57 
 
 
2320 aa  482  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5753  amino acid adenylation domain protein  27.1 
 
 
1525 aa  483  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  30.33 
 
 
1525 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.12 
 
 
4991 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  33.79 
 
 
2626 aa  475  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  31.76 
 
 
7712 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  29.65 
 
 
3432 aa  476  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  30.36 
 
 
2875 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  28.59 
 
 
2033 aa  473  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  30.06 
 
 
4342 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  26.93 
 
 
1870 aa  470  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.6 
 
 
2156 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.21 
 
 
3018 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  29.79 
 
 
4342 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  26.94 
 
 
2164 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.09 
 
 
4968 aa  466  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  27.04 
 
 
1870 aa  466  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  28.02 
 
 
1518 aa  459  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.5 
 
 
2883 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  32.09 
 
 
5750 aa  458  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  36.47 
 
 
3231 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  36.47 
 
 
3231 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  26.55 
 
 
3395 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  26.55 
 
 
2006 aa  459  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  30.03 
 
 
2628 aa  457  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  31.09 
 
 
11233 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  33.27 
 
 
2606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  34.76 
 
 
3230 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.54 
 
 
3942 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  34.13 
 
 
3224 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  28.88 
 
 
1578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  30.31 
 
 
3404 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  29.52 
 
 
2625 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  32.13 
 
 
6113 aa  452  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  27.93 
 
 
1518 aa  453  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  27.99 
 
 
1518 aa  453  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  34.43 
 
 
2651 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  28.02 
 
 
2571 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  28.02 
 
 
2571 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  26.98 
 
 
2156 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.96 
 
 
6404 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  35.4 
 
 
3219 aa  447  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  33.73 
 
 
3180 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  27.11 
 
 
2156 aa  446  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>