16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3936 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 235 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  97.02 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  50.65 
 
 		 232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  48.48 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  33.78 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  32.49 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  32.86 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  32.59 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  32.67 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  32.65 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  26.26 
 
 		 378 aa  62  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  29.94 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1281  type IV pilus assembly PilZ  21.74 
 
 		 629 aa  59.3  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  26.62 
 
 		 360 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>