19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1386 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1386  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000365631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2896  hypothetical protein  96.67 
 
 		 90 aa  176  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.63466e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2780  hypothetical protein  53.85 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000634208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0385  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1763  hypothetical protein  37.88 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.303633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0595  hypothetical protein  44.74 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0582  hypothetical protein  44.74 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000451193  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0694  hypothetical protein  44.58 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000327351  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0152  hypothetical protein  34.21 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01350  hypothetical protein  42.86 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.681566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2461  hypothetical protein  50 
 
 		 284 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2987  hypothetical protein  39.76 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  46.34 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0639  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2671  hypothetical protein  58.62 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654749  normal  0.0560512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2463  hypothetical protein  33.9 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.361588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  30.68 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2971  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>