18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0722 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0722  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  818    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0735  hypothetical protein  85.75 
 
 		 388 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000163434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2390  hypothetical protein  66.75 
 
 		 372 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3386  putative lipoprotein  81.16 
 
 		 365 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3525  putative lipoprotein  62.34 
 
 		 396 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1911  lipoprotein, putative  62.34 
 
 		 377 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0952  hypothetical protein  63.69 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1613  putative lipoprotein  59.25 
 
 		 345 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  0.214118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3464  hypothetical protein  57.3 
 
 		 351 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0382071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1129  putative lipoprotein  37.21 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44508  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0472  hypothetical protein  32.06 
 
 		 483 aa  150  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1466  hypothetical protein  30.27 
 
 		 548 aa  126  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29110  hypothetical protein  27.61 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1554  putative lipoprotein  29.65 
 
 		 548 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1713  putative lipoprotein  30.47 
 
 		 567 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0202  hypothetical protein  29.32 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0102332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  29.03 
 
 		 489 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2240  putative lipoprotein  26.04 
 
 		 594 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.837657  hitchhiker  0.00139482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>