29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0547 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  100 
 
 		 85 aa  174  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  33.75 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  32.93 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  35.06 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  35.53 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  30.38 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0732  hypothetical protein  34.62 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000191496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  33.78 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  37.18 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  37.33 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  46 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  43.33 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  32 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  32.91 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  37.18 
 
 		 84 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  33.77 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  26.19 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0266  hypothetical protein  32.73 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2021  hypothetical protein  32.14 
 
 		 78 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0133  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0275  hypothetical protein  41.3 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0227705  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2184  hypothetical protein  38.3 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  30 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>