18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0376 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  94.12 
 
 		 238 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  32.9 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  31.47 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  31.47 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  32.59 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  31.7 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  32.08 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  30.13 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  32.02 
 
 		 417 aa  85.9  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  28.1 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  27.43 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  29.08 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1281  type IV pilus assembly PilZ  22.97 
 
 		 629 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  28.93 
 
 		 378 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0549  heme NO binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 417 aa  48.9  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.197755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  22.22 
 
 		 360 aa  42.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1707  type IV pilus assembly PilZ  23.66 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0815372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>