62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0253 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0237  putative serine protein kinase, PrkA  99.12 
 
 		 683 aa  1398    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4308  putative serine protein kinase, PrkA  79.5 
 
 		 686 aa  1153    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.228625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1718  putative serine protein kinase, PrkA  83.31 
 
 		 684 aa  1196    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0030  putative serine protein kinase, PrkA  79.94 
 
 		 686 aa  1143    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0714631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3341  hypothetical protein  80.7 
 
 		 654 aa  1108    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.830716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0253  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 		 683 aa  1408    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  22.59 
 
 		 690 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  22.45 
 
 		 690 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  22.45 
 
 		 690 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  21.65 
 
 		 692 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  22.37 
 
 		 681 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  21.68 
 
 		 690 aa  91.3  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  22.01 
 
 		 694 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  23.68 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  22.59 
 
 		 644 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  24.45 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  24.45 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  21.61 
 
 		 692 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  22.82 
 
 		 632 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  21.35 
 
 		 692 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  19.71 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  22.1 
 
 		 681 aa  74.3  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  20 
 
 		 690 aa  73.2  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  22.84 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  22.69 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  22.69 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  19.78 
 
 		 690 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  22.98 
 
 		 633 aa  70.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  21.9 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  22.65 
 
 		 630 aa  70.5  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  22.37 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  19.82 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  21.52 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  22.99 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  21.86 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  20.26 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  24.17 
 
 		 631 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  24.69 
 
 		 643 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  22 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  20.98 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  22.94 
 
 		 640 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3963  putative serine protein kinase, PrkA  22.09 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  27.35 
 
 		 847 aa  48.1  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  22.38 
 
 		 644 aa  47.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2820  putative serine protein kinase, PrkA  22.06 
 
 		 647 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2257  putative serine protein kinase, PrkA  22.64 
 
 		 644 aa  45.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1394  putative serine protein kinase, PrkA  21.23 
 
 		 640 aa  45.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2725  hypothetical protein  21.28 
 
 		 643 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2856  hypothetical protein  21.28 
 
 		 643 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2007  serine kinase family protein  22.35 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1869  serine kinase family protein  22.35 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.183837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1849  putative serine protein kinase, PrkA  22.35 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159984  normal  0.0123748 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1408  serine kinase family protein  22.35 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0526547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2507  serine kinase family protein  22.35 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.106478  normal  0.925793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1859  putative serine protein kinase, PrkA  22.35 
 
 		 644 aa  43.9  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00683422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>