16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0250 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0250  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1129    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0234  hypothetical protein  93.38 
 
 		 564 aa  1043    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0687  hypothetical protein  21.4 
 
 		 591 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.169306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.26 
 
 		 545 aa  87.8  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2816  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.23 
 
 		 720 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2040  PBS lyase heat-like repeat protein  24.56 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.96 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.34 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  24.74 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.59 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.05 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1178  PBS HEAT-like repeat-containing protein  22.99 
 
 		 719 aa  57  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.41 
 
 		 557 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.85 
 
 		 546 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0698  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.64 
 
 		 753 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.28 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>