27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2766 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  100 
 
 
207 aa  407  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  33.19 
 
 
246 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  40.84 
 
 
233 aa  128  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  31.6 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  34.76 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  32.3 
 
 
231 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  31.42 
 
 
232 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  30.21 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  31.63 
 
 
239 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  32.08 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  28.31 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  25.13 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  25.57 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  24.12 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  24.12 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  24.43 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  23.53 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  22.62 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  25.15 
 
 
278 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  35.48 
 
 
292 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  22.33 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43009  NiCoT family transporter: nickel ion; high affinity nickel transporter-like protein  23 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0978739  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  23.58 
 
 
997 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0110  high-affinity nickel-transporter  27.49 
 
 
250 aa  45.1  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0795  high-affinity nickel-transporter  27.54 
 
 
352 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93398  predicted protein  31.15 
 
 
329 aa  42.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0731  high-affinity nickel-transporter  27.54 
 
 
362 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>