14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2081 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2081  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0421123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0611  hypothetical protein  51.12 
 
 
312 aa  320  1.9999999999999998e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.260773  normal  0.0246617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  30.26 
 
 
328 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  27.3 
 
 
330 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  27.74 
 
 
333 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0735  hypothetical protein  27.62 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0102  Aldose 1-epimerase  23.15 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0427  hypothetical protein  38.64 
 
 
122 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0341  hypothetical protein  21.79 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0432  Aldose 1-epimerase  22.15 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5014  hypothetical protein  27.52 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15636  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  44.44 
 
 
642 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4678  hypothetical protein  23.81 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00455816  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1820  hypothetical protein  22.75 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00406664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>