37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3248 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3248  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  77.12 
 
 		 134 aa  194  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  62.18 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  50.42 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  49.55 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  47.75 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  46.61 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1421  hypothetical protein  31.53 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0950425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  27.52 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  31.96 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  25.93 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  27.55 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  31.63 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  25 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  25.93 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  25.93 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  25.93 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  28.44 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  25.93 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  29.63 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  29.73 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  27.52 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  24.11 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  26.96 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  27.55 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  24.79 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  24.74 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  23.64 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  26.85 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1895  hypothetical protein  41.18 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  26.61 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2188  hypothetical protein  41.18 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2046  hypothetical protein  44 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00536411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>