16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1841 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1841  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.191726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.73 
 
 		 392 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1750  hypothetical protein  35.54 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0175059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1938  VanZ family protein  42.55 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0188  VanZ family protein  32.76 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.68802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1516  hypothetical protein  44.55 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00121071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0031  integral membrane protein  30.19 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0727077  normal  0.0186699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1376  VanZ like protein  38.96 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.429052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  38.68 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0771  VanZ like protein  33.93 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1710  hypothetical protein  31.73 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3829  VanZ family protein  30.36 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.942243 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0813  VanZ family protein  33.96 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.306851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  31.31 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0731  VanZ family protein  31.31 
 
 		 118 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0437  hypothetical protein  27.73 
 
 		 130 aa  40  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>