64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1157 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1157  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  187  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2411  hypothetical protein  67.39 
 
 
93 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137349  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1452  hypothetical protein  58.06 
 
 
93 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.454919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  56.52 
 
 
93 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000331281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2730  protein of unknown function DUF503  55.43 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3266  protein of unknown function DUF503  43.48 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0150914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0985  protein of unknown function DUF503  42.39 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.531041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  43.48 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  43.48 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  38.04 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2992  protein of unknown function DUF503  40.43 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3704  hypothetical protein  39.13 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.349544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  41.57 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1545  hypothetical protein  41.1 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000254696  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  40.91 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2065  hypothetical protein  42.67 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2358  hypothetical protein  42.67 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  45.16 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2048  protein of unknown function DUF503  33.8 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  35 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0956  hypothetical protein  33.77 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  36.62 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  35.96 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  38.46 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1156  protein of unknown function DUF503  32.31 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1716  protein of unknown function DUF503  40.91 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.725968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  32 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000276858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  38.1 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  45.61 
 
 
280 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3823  hypothetical protein  41.67 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8421e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  41.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  48.15 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000640284  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  37.31 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1177  hypothetical protein  37.14 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1183  hypothetical protein  35.96 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475704  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2464  hypothetical protein  43.75 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0145218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  32.58 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2785  protein of unknown function DUF503  36 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.955707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  30.56 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  34.83 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5833  protein of unknown function DUF503  34.83 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.758203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  34.83 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1067  protein of unknown function DUF503  35.96 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.540622  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  43.55 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0859  hypothetical protein  32.94 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  45.45 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  37.5 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  43.86 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3135  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3197  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397564  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3147  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.647728  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0881  hypothetical protein  31.52 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  45.9 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  33.85 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>