34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4105 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  879    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  89.86 
 
 		 443 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  59.33 
 
 		 425 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  58.15 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  56.78 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  41.38 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  39.95 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  37.82 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  39.6 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  37.9 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  38.84 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  39.21 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  38 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  38.98 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  39.21 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  37.04 
 
 		 474 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  38.37 
 
 		 474 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  37.11 
 
 		 474 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  39.66 
 
 		 475 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  38.54 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  44.19 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  42.51 
 
 		 382 aa  239  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  41.85 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  37.9 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.04 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  22.62 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.83 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  24.4 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  21.36 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  20.71 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0072  thioredoxin domain-containing protein  34.67 
 
 		 134 aa  57  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  23.11 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1106  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.28 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35 
 
 		 81 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>