16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4020 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4020  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05995e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3936  type IV pilus assembly PilZ  97.02 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0191  hypothetical protein  50.22 
 
 		 232 aa  221  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0137  hypothetical protein  48.05 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.983303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1967  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 234 aa  161  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1679  type IV pilus assembly PilZ  32.89 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00152995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1040  type IV pilus assembly PilZ  32.07 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1878  type IV pilus assembly PilZ  32.86 
 
 		 239 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000011309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0356  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000798491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0376  type IV pilus assembly PilZ  31.7 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0403  type IV pilus assembly PilZ  32.67 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0929712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1395  type IV pilus assembly PilZ  32.65 
 
 		 417 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.074973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0122  type IV pilus assembly PilZ  26.26 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0984  type IV pilus assembly protein PilZ  28.66 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.935155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1281  type IV pilus assembly PilZ  21.26 
 
 		 629 aa  58.5  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1697  type IV pilus assembly protein PilZ  25 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00195007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>