22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3177 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3177  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  194  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1084  hypothetical protein  95 
 
 		 100 aa  190  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.482733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2867  hypothetical protein  56.96 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1246  hypothetical protein  47.56 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1208  hypothetical protein  42.68 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2883  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0491  hypothetical protein  47.56 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4335  hypothetical protein  43.59 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  hitchhiker  0.00593874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2385  hypothetical protein  43.37 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2863  hypothetical protein  41.25 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2955  hypothetical protein  41.25 
 
 		 87 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3647  hypothetical protein  42.35 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2790  hypothetical protein  38.55 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4495  hypothetical protein  44.3 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0547  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.962654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0559  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13352e-20 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0266  hypothetical protein  28.77 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4316  hypothetical protein  28.95 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0719  hypothetical protein  32.76 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0230669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2354  hypothetical protein  33.87 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3412  hypothetical protein  31.25 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70735  normal  0.137668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>