24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0776 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0760  hypothetical protein  91.55 
 
 
592 aa  1121    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.554801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2218  hypothetical protein  60.4 
 
 
575 aa  711    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000179043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3128  hypothetical protein  61.76 
 
 
562 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0776  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1205    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3633  hypothetical protein  57.84 
 
 
589 aa  676    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.832641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2199  hypothetical protein  52.78 
 
 
531 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3090  hypothetical protein  47.61 
 
 
538 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0974  hypothetical protein  59.66 
 
 
488 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1036  hypothetical protein  59.32 
 
 
488 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.823153  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1033  hypothetical protein  59.56 
 
 
488 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4059  hypothetical protein  29.47 
 
 
570 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3179  hypothetical protein  30.05 
 
 
601 aa  194  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0478  hypothetical protein  30 
 
 
574 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.486321  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  30 
 
 
574 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0459  hypothetical protein  29.78 
 
 
574 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4143  hypothetical protein  30.27 
 
 
574 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3555  hypothetical protein  28.82 
 
 
570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.688598  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0440  hypothetical protein  29.98 
 
 
576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3689  hypothetical protein  29.98 
 
 
576 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0515  hypothetical protein  29.15 
 
 
570 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.363208  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3512  hypothetical protein  29.83 
 
 
576 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2269  hypothetical protein  22.22 
 
 
515 aa  92  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1185  hypothetical protein  26.25 
 
 
466 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1304  hypothetical protein  25.42 
 
 
476 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>