54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0237 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0253  putative serine protein kinase, PrkA  99.12 
 
 		 683 aa  1398    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4308  putative serine protein kinase, PrkA  79.79 
 
 		 686 aa  1155    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.228625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0237  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 		 683 aa  1407    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1718  putative serine protein kinase, PrkA  83.46 
 
 		 684 aa  1193    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3341  hypothetical protein  80.86 
 
 		 654 aa  1110    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.830716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0030  putative serine protein kinase, PrkA  80.53 
 
 		 686 aa  1149    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0714631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  22 
 
 		 690 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  21.85 
 
 		 690 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  21.85 
 
 		 690 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  21.53 
 
 		 690 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  21.61 
 
 		 692 aa  91.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  22.37 
 
 		 681 aa  90.9  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  22.6 
 
 		 644 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  23.68 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  22.01 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  24.24 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  24.24 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  21.37 
 
 		 692 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  20.79 
 
 		 690 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  23.4 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  20.51 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  19.94 
 
 		 690 aa  74.3  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  21.21 
 
 		 692 aa  73.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  22.15 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  22.84 
 
 		 631 aa  72  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  22.69 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  22.69 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  22.98 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  22.69 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  22.65 
 
 		 630 aa  70.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  22.37 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  20.35 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  21.61 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  21.75 
 
 		 631 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  24.17 
 
 		 631 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  20.63 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  21.16 
 
 		 709 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  22.87 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  24.53 
 
 		 643 aa  64.7  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  22 
 
 		 631 aa  62  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  20.98 
 
 		 631 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  21.81 
 
 		 644 aa  47.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3963  putative serine protein kinase, PrkA  21.75 
 
 		 650 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  22.07 
 
 		 640 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1394  putative serine protein kinase, PrkA  21.38 
 
 		 640 aa  45.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  26.92 
 
 		 847 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2725  hypothetical protein  21.28 
 
 		 643 aa  45.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2856  hypothetical protein  21.28 
 
 		 643 aa  45.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>