23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1376 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1102    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  30.51 
 
 		 558 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  31.92 
 
 		 597 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  35.11 
 
 		 594 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  35.42 
 
 		 622 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  27.72 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  23.7 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  23.75 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  26.27 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  23.13 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  20.94 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.45 
 
 		 260 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2986  protein of unknown function DUF324  33.19 
 
 		 541 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0321062  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.17 
 
 		 282 aa  53.5  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.86 
 
 		 288 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.46 
 
 		 289 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1677  CRISPR-associated RAMP protein  21.26 
 
 		 450 aa  51.2  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.71005  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  27.83 
 
 		 280 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0184  hypothetical protein  29.65 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  27.5 
 
 		 299 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1149  hypothetical protein  30.72 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0538158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  29.34 
 
 		 251 aa  44.3  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  28.84 
 
 		 274 aa  43.9  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>