52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4024 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4024  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  574  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1938  hypothetical protein  56.4 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162876  normal  0.0969358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0609  hypothetical protein  39.32 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  29.33 
 
 		 388 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  28.44 
 
 		 493 aa  85.9  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  28.96 
 
 		 389 aa  85.9  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  33.73 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  28.51 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  28.51 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  28.51 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  28.51 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  28.51 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  29.33 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  28.51 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  28.51 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  28.44 
 
 		 492 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  28.51 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  34.93 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  31.8 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  31.98 
 
 		 562 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  27.85 
 
 		 472 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2439  hypothetical protein  34.01 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265104  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7112  hypothetical protein  39.29 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2572  hypothetical protein  30.17 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  30.77 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  31.55 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  31.55 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  31.55 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  31.55 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  31.55 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  31.55 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  27.07 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  27.07 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  27.07 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  27.07 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  27.07 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  28.5 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  26.69 
 
 		 482 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  26.69 
 
 		 482 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  26.69 
 
 		 482 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  26.69 
 
 		 482 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  26.69 
 
 		 482 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  32.04 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  33.72 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  30.24 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>