More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3887 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3887  adenylate kinase  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0839  adenylate kinase  85.38 
 
 		 218 aa  377  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.257745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2965  adenylate kinase  62.44 
 
 		 215 aa  274  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  40.95 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  35.27 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  37.25 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  35.21 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  37.02 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  37.14 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  34.95 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  36.02 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  31.92 
 
 		 214 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  34.95 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  34.95 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.23 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  38.31 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  36.41 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  40.19 
 
 		 215 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  36.23 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  40.89 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  37.13 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  40.89 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  36.71 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  34.36 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  38.42 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  38.74 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  38.83 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  34.48 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  34.48 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  37.14 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  35.68 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  36.54 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  33.98 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  38.1 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  34.78 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  38.1 
 
 		 220 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  39.7 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  35.58 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  38.78 
 
 		 423 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1912  adenylate kinase  35.27 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.298172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  36.79 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  33.01 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  40.2 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  39.9 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  32.37 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0286  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  35.27 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  36.71 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  33.82 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0010  adenylate kinases  36.41 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  33.5 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  38.54 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  33.33 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  34.87 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  34.93 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  36.41 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  38.67 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  38.12 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  37.7 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  37.3 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  35.58 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  36.26 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  35.68 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  33.33 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  35.24 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  35.24 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  37.7 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  31.13 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  37.56 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  35.92 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  35.71 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2252  adenylate kinase  33.82 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  35.27 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  37.16 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  37.16 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  37.3 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  36.61 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  37.57 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  37.16 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  37.16 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0311  adenylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173731  unclonable  2.3199200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  37.56 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0419  adenylate kinase  36.32 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0670821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  37.16 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  34.76 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  33.33 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>