11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3328 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3328  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  258  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00365817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1366  hypothetical protein  47.29 
 
 		 179 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1229  hypothetical protein  38.05 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172727  hitchhiker  0.00916576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4136  TadE family protein  35.25 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0677  hypothetical protein  37.8 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1547  hypothetical protein  36.72 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2588  hypothetical protein  42.86 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0661216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8594  hypothetical protein  37.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.433513  normal  0.881427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1731  hypothetical protein  41.32 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000472333  normal  0.0606167 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3425  TadE family protein  40 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4038  hypothetical protein  45.95 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31046  normal  0.0267217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>