15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2998 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  354  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0724  hypothetical protein  51.91 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00634276  normal  0.0883262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3513  hypothetical protein  44.36 
 
 		 251 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0503  hypothetical protein  43.8 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0626  putative secreted lipoprotein  41.78 
 
 		 213 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0809  hypothetical protein  39.01 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.612305  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0753  putative secreted lipoprotein  39.52 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03420  hypothetical protein  37.41 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3561  hypothetical protein  36.24 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2470  hypothetical protein  38.36 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 		 590 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0554  peptidase C14, caspase catalytic subunit P20  31.06 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2371  hypothetical protein  37.11 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0423273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0739  hypothetical protein  33.88 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0713  hypothetical protein  29.93 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>