43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2439 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265104  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  91.82 
 
 		 562 aa  295  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2572  hypothetical protein  74.34 
 
 		 191 aa  237  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4024  hypothetical protein  34.01 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  28.57 
 
 		 472 aa  62.4  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  33.33 
 
 		 388 aa  62  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0609  hypothetical protein  28.77 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  32.18 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  32.18 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  29.17 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  32.18 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  32.18 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7112  hypothetical protein  40.23 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.55 
 
 		 511 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  29.07 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.3 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1938  hypothetical protein  30.46 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162876  normal  0.0969358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4021  hypothetical protein  65 
 
 		 126 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.99528 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  27.33 
 
 		 382 aa  49.3  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  43.86 
 
 		 284 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  22.54 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  22.54 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  22.54 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  22.54 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  22.54 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  22.54 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  48.21 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  28.33 
 
 		 483 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  36.11 
 
 		 407 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  26.19 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  26.19 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  26.51 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  26.19 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  26.51 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  26.19 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  26.19 
 
 		 482 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>